Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms