Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF1Q9Y548 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF1Q9Y548 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms