Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4Z2

NEUROG3, Neurogenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROG3Q9Y4Z2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROG3Q9Y4Z2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NEUROG3Q9Y4Z2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEUROG3Q9Y4Z2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEUROG3Q9Y4Z2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEUROG3Q9Y4Z2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NEUROG3Q9Y4Z2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NEUROG3Q9Y4Z2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROG3Q9Y4Z2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROG3Q9Y4Z2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms