Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHTOPQ9Y3Y2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms