Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y240

CLEC11A, C-type lectin domain family 11 member A, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC11AQ9Y240 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLEC11AQ9Y240 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLEC11AQ9Y240 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms