Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNEQ9Y223 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms