Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AGTPBP1Q9UPW5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGTPBP1Q9UPW5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms