Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC8A2Q9UPR5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC8A2Q9UPR5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC8A2Q9UPR5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A2Q9UPR5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A2Q9UPR5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A2Q9UPR5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A2Q9UPR5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A2Q9UPR5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A2Q9UPR5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A2Q9UPR5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A2Q9UPR5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A2Q9UPR5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A2Q9UPR5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A2Q9UPR5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC8A2Q9UPR5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC8A2Q9UPR5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A2Q9UPR5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms