Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCG2Q9UNQ0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABCG2Q9UNQ0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCG2Q9UNQ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCG2Q9UNQ0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCG2Q9UNQ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCG2Q9UNQ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCG2Q9UNQ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms