Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
L1RE1Q9UN81 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1RE1Q9UN81 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms