Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB23Q9ULC3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB23Q9ULC3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
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