Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA3Q9UL41 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms