Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms