Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN16Q9UKR8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN16Q9UKR8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms