Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHIC2Q9UKJ5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHIC2Q9UKJ5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHIC2Q9UKJ5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms