Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRTO4Q9UKD2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms