Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms