Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP3AQ9UFN0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms