Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUX4Q9UBX2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4Q9UBX2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms