Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms