Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC17A7Q9P2U7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms