Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC44.73■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC44.71■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC44.71■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC44.71■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC44.7■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC44.7■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC44.68■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC44.67■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC44.67■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC44.66■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC44.65■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC44.65■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
CCDC180Q9P1Z9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC44.62■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC44.62■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
CCDC180Q9P1Z9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms