Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HACD3Q9P035 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HACD3Q9P035 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms