Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MSRB1Q9NZV6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms