Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP1Q9NZI2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP1Q9NZI2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms