Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GGA3Q9NZ52 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GGA3Q9NZ52 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms