Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms