Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR4Q9NYA4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms