Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMPD3Q9NY59 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms