Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY37

ASIC5, Acid-sensing ion channel 5, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC5Q9NY37 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ASIC5Q9NY37 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ASIC5Q9NY37 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC5Q9NY37 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC5Q9NY37 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC5Q9NY37 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC5Q9NY37 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC5Q9NY37 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC5Q9NY37 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC5Q9NY37 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC5Q9NY37 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC5Q9NY37 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIC5Q9NY37 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASIC5Q9NY37 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASIC5Q9NY37 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms