Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms