Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
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