Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms