Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms