Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms