Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPORSQ9NS56 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms