Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHPT1Q9NRX4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHPT1Q9NRX4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms