Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBN1Q9NPG3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
UBN1Q9NPG3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBN1Q9NPG3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBN1Q9NPG3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBN1Q9NPG3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBN1Q9NPG3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBN1Q9NPG3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBN1Q9NPG3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms