Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms