Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKRIP1Q9H875 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKRIP1Q9H875 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms