Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TDRD3Q9H7E2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRD3Q9H7E2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms