Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF3Q9H4D5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms