Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIOBPQ9H2D6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIOBPQ9H2D6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms