Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR88Q9GZN0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPR88Q9GZN0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms