Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNTNAP4Q9C0A0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms