Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABARAPL3Q9BY60 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABARAPL3Q9BY60 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms