Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms