Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRTQ9BXP5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms