Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM2Q9BVW6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms