Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCMBPQ9BTE3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms